Isla Baltra, también conocida como Seymour Sur, es realmente la entrada a las Islas Galápagos. A pesar de no estar considerada como parte del Parque Nacional, Baltra ofrece sin duda una muestra de la extraña y maravillosa naturaleza que prospera en las islas. La isla está situada en la parte central del archipiélago. Con sólo ocho kilómetros cuadrados, es una de las islas más pequeñas, pero su superficie plana de roca volcánica y su ubicación central en el archipiélago la convierten en un lugar ideal para uno de los dos aeropuertos de las islas. El aeropuerto fue construido por las Fuerzas Aéreas estadounidenses, que lo utilizaron como base militar durante la Segunda Guerra Mundial. Como destino turístico ofrece pocos atractivos, y todos los viajeros llegan aquí están de paso, ya sea de ida o de vuelta a las islas. En Baltra no hay infraestructuras turísticas (salvo unas pocas agencias que ofrecen visitas a las islas) ni tiendas, y cualquier compra que se desee realizar debe hacerse en el aeropuerto, si se puede. Sin embargo, las iguanas terrestres y los pinzones de las Galápagos son lugares de interés, y las iguanas se ven a menudo corriendo por la propia pista. Le sorprenderá ver cómo los juguetones leones marinos y algunas aves marinas le dan la bienvenida en el muelle.
Al norte de Santa Cruz, Daphne Major es una pequeña isla volcánica, un cono de toba con poca vegetación y una superficie de menos de medio kilómetro cuadrado. Es muy difícil desembarcar en ella y sólo puede visitarse con un permiso especial. La mayoría de los barcos sólo pasan por delante de ella o incluso pueden circunvalar la isla. Sin árboles grandes, el borde del cono del volcán se eleva a 120 metros. Los arbustos de cactus, los pequeños árboles y las hierbas proporcionan alimento a varias especies de pinzones, y un estudio pionero sobre la evolución en un periodo de cuarenta años demostró cómo la disponibilidad de recursos alimenticios ha provocado cambios evolutivos en los pinzones. Además de estos pequeños pájaros terrestres, en Daphne Major anidan también los pájaros tropicales de pico rojo, las magníficas fragatas y los piqueros de patas azules y de Nazca, a los que a menudo se puede ver volar.